Ce traité aborde essentiellement l'étude des propriétés et des concepts physico-chimiques caractéristiques du monde biologique à l'échelle moléculaire....
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Ce traité aborde essentiellement l'étude des propriétés et des concepts physico-chimiques caractéristiques du monde biologique à l'échelle moléculaire. Il met l'accent sur l'aspect dynamique des processus biologiques, où les structures moléculaires évoluent continuellement au cours du temps et où l'importance des phénomènes aléatoires croît avec la complexité du système. L'auteur montre que les lois physiques et physico-chimiques s'appliquent aux acteurs du jeu biologique (eau, ions, molécules et macromolécules).
Par une approche trandisciplinaire, il rassemble des éléments habituellement traités de façon fragmentaire et met à la disposition des étudiants un véritable manuel de travail unique en son genre.
L'ouvrage tient compte des formations de départ souvent hétérogènes, limitant en particulier au strict nécessaire les développements mathématiques ; des exercices incitent le lecteur plus physicien à aller plus loin dans l'approche quantitative des phénomènes biologiques.
Sommaire
Conformation des biopolymères
Géométrie d'une chaîne de polymère
Forces intermoléculaires
Calcul des conformations
Conformations des acides nucléiques
Conformation des protéines
Dynamique des biopolymères
Fluctuations autour d'une conformation d'équilibre
Mouvement brownien
Passage d'une conformation à une autre ou transconformation
Méthodes expérimentales
Méthodes de modélisation de la dynamique intramoléculaire
Hydratation des biopolymères
Propriétés de l'eau
Molécules hydrophobes et hydrophiles
Hydratation des protéines
Hydratation des acides nucléiques
Les biopolymères comme polyélectrolytes
Distribution des charges
Lois et relations
Solutions d'électrolytes et théorie de Debye-Hückel
Solutions de polyélectrolytes
Etude du modèle continu
Modèles discontinus ou mixtes
Perméabilité cellulaire et transport d'ions
Association entre molécules
Etude à l'équilibre
Etude cinétique et diffusion facilitée
Spécificité de reconnaissance
Eléments de reconnaissance entre protéines et acides nucléiques