Constantinople, 1203. Tandis que la quatrième Croisade met la ville à feu et à sang, un groupe de Templiers parvient à s'infiltrer dans la bibliothèque impériale afin d'y dérober des documents secrets qui ne doivent en aucun cas arriver entre les mains du doge de Venise. Les hommes parviennent à voler trois coffres recelant de dangereux secrets. Mais ils ne vivront pas assez longtemps pour les découvrir.
Le Vatican, de nos jours. Sean Reilly, agent du FBI, a le privilège de pouvoir consulter les archives secrètes de l'Inquisition, auxquelles seule la garde rapprochée du pape a normalement accès. Pour sauver celle qu'il aime, il ne va pas tarder à violer la confiance du Saint-Siège. En effet, Tess a été enlevée, et la clé de sa liberté se trouve dans l'un des documents archivés : le Fondo Templari, une histoire secrète des Templiers.